Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms