Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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