Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms