Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spatc1Q148B6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms