Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrioQ0KL02 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms