Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc7a1Q09143 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc7a1Q09143 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms