Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ncf1Q09014 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms