Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnma1Q08460 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnma1Q08460 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms