Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms