Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms