Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms