Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms