Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms