Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smn1P97801 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smn1P97801 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms