Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmsP97355 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SmsP97355 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SmsP97355 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SmsP97355 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmsP97355 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SmsP97355 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms