Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rps3aP97351 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rps3aP97351 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms