Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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