Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb2P81069 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms