Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx3P81067 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx3P81067 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms