Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms