Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfi1P70338 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gfi1P70338 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gfi1P70338 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms