Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms