Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crnkl1P63154 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms