Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms