Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia3P60469 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms