Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp4P59240 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms