Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lim2P56563 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lim2P56563 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lim2P56563 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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