Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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