Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh3bp1P55194 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Sh3bp1P55194 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Sh3bp1P55194 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp1P55194 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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