Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PctpP53808 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms