Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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