Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TspoP50637 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TspoP50637 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TspoP50637 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms