Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SftpbP50405 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SftpbP50405 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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