Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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