Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdhaP50136 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms