Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtshP49935 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtshP49935 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms