Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rph3aP47708 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3aP47708 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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