Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rab11bP46638 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rab11bP46638 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms