Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sept1P42209 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms