Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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