Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig1P37913 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms