Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PtprkP35822 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms