Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxa10P31310 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms