Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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