Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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