Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nfkb1P25799 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nfkb1P25799 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms