Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf239P24399 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf239P24399 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf239P24399 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms