Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PparaP23204 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PparaP23204 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms