Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntf3P20181 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms