Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VimP20152 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VimP20152 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VimP20152 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms